Dans un coin oublié du monde, où les frontières entre le passé et le présent se brouillent, Sonic et ses amis rencontrent des alliés et des ennemis que le temps semblait avoir laissés derrière lui. De nouvelles amitiés se nouent et d’anciennes rivalités refont surface tandis qu’ils affrontent une menace qui met en péril l’existence même de leur univers. L’Émeraude Arc-en-ciel est une gemme légendaire qui renferme un pouvoir immense. L’utilisateur, son protecteur, doit empêcher qu’elle ne tombe entre de mauvaises mains tout en voyageant aux côtés de Sonic et de ses amis à travers des lieux emblématiques de l’univers de Sonic.